More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25580 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25580  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  191  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  54.22 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0684  transcriptional regulator, HxlR family  56.25 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  46.51 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  55.42 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  49.4 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  54.02 
 
 		 107 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  51.25 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  50.6 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  48.91 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  51.81 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  50 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  48.84 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  50 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  50 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  51.14 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  50.6 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  49.43 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  49.43 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  44.19 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25590  predicted transcriptional regulator  43.37 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.6055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  50.6 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  49.43 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  49.43 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  43.68 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  49.43 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  48.28 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0069  transcriptional regulator, HxlR family  45.78 
 
 		 110 aa  84.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.700237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3490  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  45.24 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1717  transcriptional regulator, putative  50.68 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1531  transcriptional regulator, putative  50.68 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0341  transcriptional regulator, MarR family  44.58 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45733  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1769  transcriptional regulator superfamily  47.78 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1527  transcriptional regulator, HxlR family  49.38 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0577409  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  47.67 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  43.68 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  43.02 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  46.15 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  46.99 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45.98 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  48.28 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>