More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1090 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  198  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  59.14 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4243  transcriptional regulator, HxlR family  41.49 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333534  normal  0.800382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.76 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  47.25 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.01 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  40.21 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.82 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  44.68 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1551  transcriptional regulator, HxlR family  51.39 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.356298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2311  transcriptional regulator, HxlR family  44.57 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272645  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  48.45 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  41.49 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  45.36 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  39.78 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 235 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  42.27 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  42.22 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10173  YdeP  42.86 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  43.68 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2995  transcriptional regulator, HxlR family  39.36 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  38.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  42.22 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  38.95 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  43.96 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3114  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  40.45 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  43.18 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  39.58 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0361  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  41.76 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  43.21 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1166  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  39.8 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  35.79 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  35.79 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  42.86 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1480  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  43.33 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  43.21 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1070  helix-turn-helix HxlR type  35.16 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000989417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0075  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  43.21 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  43.02 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  43.21 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0639  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  41.05 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>