More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1551 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1551  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 98 aa  187  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.356298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1090  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000252079  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4243  transcriptional regulator, HxlR family  43.16 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0609  transcriptional regulator, HxlR family  49.38 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.822325  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6637  HxlR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5625  HxlR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229377  normal  0.277837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  43.16 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2843  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0861419  normal  0.0924063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1620  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1728  HxlR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  42.39 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  46.38 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  41.98 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  41.11 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  44.87 
 
 		 235 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0241  putative transcriptional regulator  43.53 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603552  normal  0.811077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  44.16 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  44.71 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  38.04 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  49.35 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1918  HxlR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.53463  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  43.21 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  37.66 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2079  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  49.35 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0618  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00866972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7647  transcriptional regulator, HxlR family  46.75 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  40.26 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.16 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  40.26 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  39.56 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2069  hypothetical protein  40.28 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0324  transcriptional regulator, HxlR family  40.26 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.948926  normal  0.0884753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1825  transcriptional regulator, HxlR family  42.31 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  40.21 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  40.48 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  38.54 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  48.57 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  41.98 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  41.3 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1171  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.299437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  47.06 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  44.44 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0377  transcriptional regulator, HxlR family  51.35 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0395493  normal  0.03196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>