More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3433 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3433  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.24132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2765  transcriptional regulator, HxlR family  43.75 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340614  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2510  transcriptional regulator, HxlR family  44.74 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4705  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2385  transcriptional regulator, HxlR family  47.22 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1997  transcriptional regulator, HxlR family  41.55 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4151  HxlR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2650  transcriptional regulator, HxlR family  46.3 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116917  normal  0.771114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0446  transcriptional regulator, HxlR family  38.71 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2243  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6178  transcriptional regulator, HxlR family  41.38 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0462511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2311  transcriptional regulator, HxlR family  45.79 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2036  helix-turn-helix HxlR type  45.79 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1615  putative transcriptional regulatory protein  42.61 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0735023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0246  putative transcriptional regulator  42.48 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1242  hypothetical protein  44.95 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  38.26 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5256  HxlR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4817  HxlR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2792  hypothetical protein  42.34 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0208  hypothetical protein  39.47 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2281  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3552  HxlR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.640344 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1296  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  normal  0.682914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8738  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2871  HxlR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0552  transcriptional regulator, HxlR family  36.29 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3743  transcriptional regulator, HxlR family  41.07 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.0400276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2706  putative transcriptional regulator  37.17 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2508  hypothetical protein  37.07 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6779  transcriptional regulator, HxlR family  36.76 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0621  HxlR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1179  HxlR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0184  HxlR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4646  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.28367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3327  transcriptional regulator, HxlR family  35.9 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2876  transcriptional regulator, HxlR family  37.39 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2312  hypothetical protein  36.21 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.866672 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4732  transcriptional regulator, HxlR family  41.59 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1367  HxlR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269622 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3815  transcriptional regulator, HxlR family  39.81 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1490  HxlR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0264  HxlR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9338  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2400  HxlR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.956461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1768  transcriptional regulator, HxlR family  39.13 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.384631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3289  transcriptional regulator, HxlR family  40.19 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0688006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5518  putative transcriptional regulatory protein  35.77 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1455  transcriptional regulator, HxlR family  41.44 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1021  putative transcriptional regulator  40.54 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.247516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0324  transcriptional regulator protein-like protein  40.71 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6638  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4023  helix-turn-helix HxlR type  38.94 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259288  normal  0.513403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2865  HxlR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.17139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0384  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4392  transcriptional regulator, HxlR family  38.94 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.201066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2523  transcriptional regulator  38.39 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2619  putative transcriptional regulator  41.23 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.329844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1776  putative transcriptional regulator  37.96 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3369  hypothetical protein  41.82 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0346683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04084  predicted transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.552706  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3781  transcriptional regulator, HxlR family  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4753  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3220  transcriptional regulator, HxlR family  40.78 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04047  hypothetical protein  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0278  putative transcriptional regulator  38.71 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.640242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1800  putative transcriptional regulator  40.19 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  40.95 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4465  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4691  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4782  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5729  putative transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3794  HxlR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.437038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  42.22 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5545  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  37.17 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3630  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2977  transcriptional regulator, HxlR family  40.71 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4737  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2138  hypothetical protein  39.17 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.30336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2255  HxlR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.018064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0523  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3919  transcriptional regulator, HxlR family  35.25 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3391  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4610  transcriptional regulator, HxlR family  34.78 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3128  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>