More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2772 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2772  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
130 aa  257  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296986  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5177  HxlR family transcriptional regulator  88.7 
 
 
118 aa  205  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4119  HxlR family transcriptional regulator  85.38 
 
 
126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4770  HxlR family transcriptional regulator  85.38 
 
 
126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3397  HxlR family transcriptional regulator  85.38 
 
 
126 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3100  HxlR family transcriptional regulator  75.96 
 
 
107 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3339  HxlR family transcriptional regulator  78.76 
 
 
103 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
114 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 
129 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  52.63 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  52.17 
 
 
125 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  46.15 
 
 
111 aa  103  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  42.86 
 
 
144 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  43.88 
 
 
110 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  42.86 
 
 
144 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  42.86 
 
 
144 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  42.86 
 
 
206 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 
119 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  43.33 
 
 
130 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  42.86 
 
 
220 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 
133 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  48.54 
 
 
132 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  47.31 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0738  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 
124 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.342617  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  48.42 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  46.32 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  48.42 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2703  transcriptional regulator, HxlR family  47.87 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  46.32 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  46.32 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  46.32 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  46.32 
 
 
126 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  46.32 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  46.32 
 
 
126 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  45.92 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  46.32 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  40.68 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9284  transcriptional regulator (MarR family protein)  54.84 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  47.96 
 
 
113 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  43.43 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  46.74 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17890  predicted transcriptional regulator  53.85 
 
 
111 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
119 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  46.94 
 
 
119 aa  94  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4164  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596618  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  46.24 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
106 aa  92  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
126 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
116 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6402  HxlR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
121 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.299726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  41.84 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0280  HxlR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.88 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  44.68 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  46.07 
 
 
107 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  45.65 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  45.65 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  44.94 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  44.94 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5174  HxlR family transcriptional regulator  47.87 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.187988  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4812  HxlR family transcriptional regulator  49 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
120 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  40.62 
 
 
119 aa  89  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
119 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  44.94 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  39.83 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  39.81 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  44.23 
 
 
113 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3527  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.502253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4370  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3996  HxlR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.208473  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3025  HxlR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 
137 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  43.1 
 
 
134 aa  87  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>