More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3097 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3157  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3117  HxlR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 314 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0817694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3097  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1806  HxlR family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.123948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1536  transcriptional regulator, MarR family  38.8 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1011  HxlR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 150 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  35.86 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 149 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  38.98 
 
 		 176 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  35.56 
 
 		 157 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.93 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  34.81 
 
 		 157 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  36.03 
 
 		 159 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 163 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 160 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 162 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 162 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  34.23 
 
 		 158 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 162 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 164 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  39.86 
 
 		 160 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  32.33 
 
 		 153 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 158 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 160 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  35.34 
 
 		 161 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  31.33 
 
 		 162 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 167 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5830  transcriptional regulator, HxlR family  33.1 
 
 		 157 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.882697  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  49.45 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6089  transcriptional regulator, HxlR family  34.35 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289609  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  36.43 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  33.33 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.19 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  36.07 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  30.15 
 
 		 168 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 149 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  35.04 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2357  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  34.65 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2365  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00413134  normal  0.867311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  35.29 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2318  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  44.94 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  44.94 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  44.94 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  44.94 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  32.06 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9299  transcriptional regulator, HxlR family  30.43 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  39.66 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  33.96 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  37.14 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  34.4 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  29.5 
 
 		 170 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  33.62 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  39.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2760  transcriptional regulator, HxlR family  31.45 
 
 		 168 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  37.14 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  31.65 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  40.62 
 
 		 106 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>