More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2188 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  99.01 
 
 
404 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  99.01 
 
 
404 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  100 
 
 
404 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  72.15 
 
 
395 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  65.91 
 
 
405 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  69.06 
 
 
402 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.95 
 
 
411 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  42.71 
 
 
399 aa  279  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  41.39 
 
 
443 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.56 
 
 
407 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.59 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  38.98 
 
 
415 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1888  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.19 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0458735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  39.04 
 
 
428 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  39.68 
 
 
442 aa  239  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  38.24 
 
 
440 aa  236  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.67 
 
 
465 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  37.89 
 
 
419 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.18 
 
 
447 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  37.56 
 
 
453 aa  226  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  39.39 
 
 
397 aa  225  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  39.08 
 
 
455 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.3 
 
 
440 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35 
 
 
449 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  40.25 
 
 
405 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.73 
 
 
450 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.28 
 
 
420 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  39.66 
 
 
412 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  36.96 
 
 
517 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  39.51 
 
 
401 aa  202  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  35.78 
 
 
413 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.6 
 
 
433 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  39.7 
 
 
417 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  36.24 
 
 
488 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  33.91 
 
 
490 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.12 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  33.87 
 
 
422 aa  180  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  28.51 
 
 
471 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  28.64 
 
 
436 aa  146  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  23.64 
 
 
435 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  27.74 
 
 
397 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  25.58 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  26.08 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  24.26 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  27.1 
 
 
424 aa  129  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  24.89 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  29.26 
 
 
473 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  26.99 
 
 
407 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  23.83 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  23.9 
 
 
419 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.18 
 
 
444 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  24.36 
 
 
446 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  26.93 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  23.37 
 
 
439 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  26.35 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  22.27 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.95 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.81 
 
 
445 aa  116  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  23.37 
 
 
439 aa  117  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2619  RNA methyltransferase  21.43 
 
 
404 aa  116  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2194  RNA methyltransferase  23.94 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  27.27 
 
 
457 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  23.3 
 
 
453 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  27.79 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.78 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  25.78 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.73 
 
 
449 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.15 
 
 
449 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  25.11 
 
 
457 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  26.05 
 
 
457 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  26.19 
 
 
460 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.85 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.85 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  22.29 
 
 
485 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  22.08 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  20.94 
 
 
446 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  21.37 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  22.53 
 
 
400 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  26.02 
 
 
378 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  35.5 
 
 
479 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  23.06 
 
 
458 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.55 
 
 
450 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  22.9 
 
 
460 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0451  (Uracil-5)-methyltransferase  21.07 
 
 
397 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.222179  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0094  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  22.41 
 
 
439 aa  107  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.146255  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  22.86 
 
 
470 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  25.4 
 
 
459 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  18.62 
 
 
415 aa  106  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  29.75 
 
 
438 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0378  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.95 
 
 
513 aa  106  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0129185 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.78 
 
 
450 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.49 
 
 
450 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0344  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.83 
 
 
512 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  24.29 
 
 
439 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.33 
 
 
450 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0947  (Uracil-5)-methyltransferase  22.69 
 
 
393 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.66 
 
 
442 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0384  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.27 
 
 
516 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397678  unclonable  0.000000000598014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.44 
 
 
440 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.28 
 
 
450 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>