More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1715 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 		 449 aa  872    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  61.19 
 
 		 407 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  58.5 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  57.53 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  55.1 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  52.09 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  48.53 
 
 		 397 aa  356  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  49.89 
 
 		 412 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  47.71 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.07 
 
 		 450 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  49.77 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.65 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.91 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  45.15 
 
 		 413 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  45.13 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.15 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  43.43 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  44.57 
 
 		 442 aa  292  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.65 
 
 		 465 aa  286  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  42.55 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.55 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.24 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.1 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  43.35 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  42.34 
 
 		 440 aa  263  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  42.95 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  36.97 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  37.88 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.5 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  35 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  35 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  35 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  35.78 
 
 		 405 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  32.95 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  36.7 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30.41 
 
 		 397 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  33.61 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  28.6 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  27.78 
 
 		 460 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27.05 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  33.63 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  30.6 
 
 		 434 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  28.36 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.53 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.51 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.53 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  29.17 
 
 		 457 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.53 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  27.37 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.06 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  28.09 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.19 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  35.55 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  28.82 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  28.06 
 
 		 458 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  29.52 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.17 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  28.54 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  27.93 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  28.99 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.69 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.73 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  26.44 
 
 		 458 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  26.44 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.96 
 
 		 460 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.24 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.77 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  26.44 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  26.44 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  25.74 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  26 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.09 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  28.34 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  26.81 
 
 		 446 aa  156  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  25.59 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  26.23 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  26.23 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  25.38 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  32.83 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.14 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.04 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  31.94 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.48 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  25.27 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  30.6 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.59 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.34 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  30.83 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  30.65 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.04 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.04 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  28.14 
 
 		 572 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>