More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1396 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  100 
 
 
397 aa  775    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  48.81 
 
 
428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  48.26 
 
 
455 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.53 
 
 
449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  49.02 
 
 
407 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  47.86 
 
 
419 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  49.03 
 
 
415 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.85 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.94 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  49.49 
 
 
399 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  49.5 
 
 
412 aa  315  7e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  46.81 
 
 
488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  49 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  48.69 
 
 
440 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  42.98 
 
 
517 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  45.08 
 
 
442 aa  282  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.36 
 
 
411 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  42.48 
 
 
413 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  43.14 
 
 
405 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46 
 
 
420 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.76 
 
 
433 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.64 
 
 
465 aa  259  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.61 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  38.15 
 
 
453 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  40.79 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.95 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  41.54 
 
 
401 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  35.32 
 
 
490 aa  225  8e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  34.77 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  39.39 
 
 
404 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  38.89 
 
 
404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  38.89 
 
 
404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  32.75 
 
 
405 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  39.61 
 
 
402 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  37.44 
 
 
405 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  37.97 
 
 
395 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  28.44 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  28.51 
 
 
435 aa  188  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  34.52 
 
 
422 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  25.87 
 
 
419 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  32.76 
 
 
471 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  28.35 
 
 
453 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  28.79 
 
 
453 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.08 
 
 
460 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.93 
 
 
455 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  31.32 
 
 
419 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.65 
 
 
436 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  29.64 
 
 
439 aa  176  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  28.73 
 
 
439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  29.84 
 
 
441 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  33.55 
 
 
465 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.42 
 
 
460 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  33.18 
 
 
439 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1888  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.77 
 
 
392 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0458735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  25.66 
 
 
446 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  31.24 
 
 
434 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 
438 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  33.25 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  26.73 
 
 
454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  28.91 
 
 
395 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.08 
 
 
450 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.9 
 
 
444 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  31.07 
 
 
423 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.08 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.08 
 
 
450 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  32.33 
 
 
457 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.67 
 
 
442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2619  RNA methyltransferase  27.67 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  27.23 
 
 
446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.17 
 
 
455 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  32.48 
 
 
378 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.98 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  29.82 
 
 
439 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.98 
 
 
463 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.22 
 
 
455 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  31.08 
 
 
456 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  26.93 
 
 
455 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.75 
 
 
463 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.02 
 
 
443 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0851  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.71 
 
 
432 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954916  hitchhiker  0.000117621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  26.61 
 
 
458 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.54 
 
 
450 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.15 
 
 
445 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0947  (Uracil-5)-methyltransferase  27.37 
 
 
393 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  32.87 
 
 
438 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  29.98 
 
 
457 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  30.68 
 
 
438 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.89 
 
 
444 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.25 
 
 
485 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.09 
 
 
450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  28.84 
 
 
400 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.47 
 
 
449 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  28.51 
 
 
459 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  28.23 
 
 
439 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.54 
 
 
471 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03529  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.99 
 
 
439 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  32.43 
 
 
407 aa  153  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  27.23 
 
 
458 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  27.34 
 
 
415 aa  152  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.11 
 
 
449 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>