More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0947 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  83.03 
 
 		 395 aa  675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0947  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 		 393 aa  811    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  86.73 
 
 		 400 aa  711    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  48.49 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  42.3 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  31.26 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  30.57 
 
 		 439 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  31.81 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  29.35 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  31.41 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  30.5 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  29.8 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  30.95 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  30 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  28.13 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  30.87 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  30.83 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  29.49 
 
 		 435 aa  176  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  29.58 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.7 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.34 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  30.59 
 
 		 457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.34 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  28.34 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 458 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  28.12 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  29.68 
 
 		 454 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  28.12 
 
 		 454 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  28.1 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  27.95 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  27.67 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  28.12 
 
 		 458 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  32.31 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.78 
 
 		 460 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.12 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.12 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  27.97 
 
 		 458 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.74 
 
 		 469 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 461 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 461 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  28.19 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  28.19 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  27.93 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  27.91 
 
 		 457 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  27.38 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  28.67 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  28.83 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  26.46 
 
 		 450 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  28.95 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.71 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  28.73 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.07 
 
 		 440 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  28.43 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  30.62 
 
 		 458 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  27.37 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.26 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  27.46 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  29.62 
 
 		 572 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  27.45 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.17 
 
 		 447 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  29.33 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.36 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.36 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  29.36 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.33 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  29.33 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.33 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.33 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.33 
 
 		 459 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  29.14 
 
 		 378 aa  155  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  27.5 
 
 		 434 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  30.02 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  26.41 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  27.34 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  26.14 
 
 		 466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  26.64 
 
 		 455 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  29.67 
 
 		 459 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  27.11 
 
 		 468 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  28.98 
 
 		 455 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  29.01 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  29.15 
 
 		 454 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.13 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  26.97 
 
 		 476 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  28.5 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  28.95 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  28.1 
 
 		 461 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  28.94 
 
 		 495 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.96 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.98 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  28.1 
 
 		 480 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  26.46 
 
 		 459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.11 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  28.85 
 
 		 446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.48 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.7 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.2 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.82 
 
 		 442 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.64 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>