More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_936 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  84.32 
 
 		 395 aa  689    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0947  (Uracil-5)-methyltransferase  86.73 
 
 		 393 aa  711    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  100 
 
 		 400 aa  827    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  48.18 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  41.62 
 
 		 405 aa  279  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  31.23 
 
 		 446 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  30.94 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 439 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  30.79 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  29.86 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  28.04 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.9 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  31.78 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  29.66 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  29.07 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.14 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  31.68 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.19 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 458 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  29.07 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.19 
 
 		 458 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 454 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  30.99 
 
 		 448 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  28.19 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  29.07 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  27.81 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.93 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.41 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.41 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  29.02 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  28.48 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  28.88 
 
 		 460 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  27.71 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  27.71 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  28.43 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  28.47 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  28.95 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  28.79 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  28.43 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  29.5 
 
 		 465 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  27.43 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  28.53 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  27.9 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.06 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  27.9 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  29.56 
 
 		 458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  29.65 
 
 		 378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.93 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.67 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  28.6 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2200  RNA methyltransferase, TrmA family  31.14 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  27.15 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1134  23S rRNA methyltransferase/RumA  27.92 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  28.38 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  28.08 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  28.43 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.57 
 
 		 459 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  28.79 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.35 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  28.35 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  28.35 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.35 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  28.73 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  27.17 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  27.25 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  29.04 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  30.12 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.83 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  28.32 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  26.54 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  28.12 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  27.91 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.65 
 
 		 493 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  28.54 
 
 		 572 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  29.57 
 
 		 495 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  28.75 
 
 		 439 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  28.18 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  30.23 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  27.59 
 
 		 441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  27.73 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  28.84 
 
 		 397 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  28.16 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  28.85 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  27.06 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.89 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.63 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.39 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  29.17 
 
 		 438 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  25.33 
 
 		 459 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  29.13 
 
 		 455 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  27.55 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.73 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  28.74 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.94 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  26.76 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.77 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>