More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5189 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  100 
 
 		 517 aa  986    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  54.6 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  46.89 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  45.47 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  45.57 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.95 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.43 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  43.18 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.59 
 
 		 450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.8 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  42.63 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  44.2 
 
 		 412 aa  269  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  44.81 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.27 
 
 		 447 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  36.45 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  38.09 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  38.54 
 
 		 440 aa  223  9e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.49 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 404 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  37.17 
 
 		 404 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  37.17 
 
 		 404 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  63.41 
 
 		 419 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  64.74 
 
 		 399 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.99 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  28.03 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  58.6 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  27.49 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  31.11 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  58.33 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  31.7 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  56.07 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  26.17 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  27.31 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  29.25 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  52.38 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  31.03 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  25.89 
 
 		 460 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.32 
 
 		 489 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  48.53 
 
 		 413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  47.98 
 
 		 405 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  24.8 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  29.62 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.51 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  28.13 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  26.87 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  26.55 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  26.16 
 
 		 435 aa  154  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.8 
 
 		 450 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  31.36 
 
 		 434 aa  153  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.05 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.7 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  32.58 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.6 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.66 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2766  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.25 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000280871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3147  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.37 
 
 		 450 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0637752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.7 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  25.55 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.6 
 
 		 488 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.2 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  28.05 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  28.57 
 
 		 378 aa  147  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  25.9 
 
 		 458 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  25.9 
 
 		 458 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.68 
 
 		 449 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  25.9 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  25.45 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  25.1 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  25.9 
 
 		 458 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  25.9 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  24.5 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  30.14 
 
 		 438 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  25.55 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  25.75 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  26.29 
 
 		 454 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  25.7 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  27.79 
 
 		 572 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  28.51 
 
 		 446 aa  143  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  24.9 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  26.1 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  27.31 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  23.67 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2450  RNA methyltransferase, TrmA family  30.86 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.211683  normal  0.124468 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2828  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.86 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.27 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.04 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.02 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  29.94 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  28.31 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1898  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.28 
 
 		 443 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.75216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  27.29 
 
 		 439 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  28.12 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.45 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  29.13 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  27.45 
 
 		 457 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  25.3 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.46 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  29.09 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  27.12 
 
 		 439 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>