More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1710 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 
420 aa  796    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  66.11 
 
 
442 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  65.64 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  58.98 
 
 
405 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  54.61 
 
 
450 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.82 
 
 
430 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.45 
 
 
465 aa  322  6e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  44.81 
 
 
453 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  45.92 
 
 
440 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.91 
 
 
407 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  46.57 
 
 
415 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  49.39 
 
 
399 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  47.53 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  44.57 
 
 
455 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.55 
 
 
449 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  47.47 
 
 
387 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  40.94 
 
 
490 aa  293  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  45.18 
 
 
419 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  46 
 
 
397 aa  286  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  44.39 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  41.8 
 
 
422 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.8 
 
 
411 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  40.17 
 
 
471 aa  266  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  46.59 
 
 
440 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  44.49 
 
 
488 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  45.89 
 
 
412 aa  253  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  44.44 
 
 
401 aa  252  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.88 
 
 
433 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  46.08 
 
 
417 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  40 
 
 
404 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  39.52 
 
 
404 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  39.52 
 
 
404 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  39.29 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  40.35 
 
 
395 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  39.32 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 
419 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  33.7 
 
 
443 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.56 
 
 
444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  24.45 
 
 
446 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1888  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40.84 
 
 
392 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0458735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  54.72 
 
 
517 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  25.38 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  20.73 
 
 
473 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  31.56 
 
 
436 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  31.13 
 
 
438 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  30.12 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  24.05 
 
 
454 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  28.47 
 
 
405 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  24.95 
 
 
460 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  26.64 
 
 
459 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  27.7 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.36 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.88 
 
 
447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.67 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.6 
 
 
443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  28.57 
 
 
378 aa  133  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  28.17 
 
 
457 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  28.27 
 
 
419 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  24.84 
 
 
453 aa  132  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2194  RNA methyltransferase  27.59 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  27.37 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  28.6 
 
 
441 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.25 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  26.92 
 
 
457 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  27.79 
 
 
455 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.16 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.14 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.08 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  25 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.59 
 
 
449 aa  130  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  26.26 
 
 
458 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  30.36 
 
 
437 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  27.63 
 
 
424 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  25.11 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  22.25 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.8 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  25.91 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  26.89 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  28.98 
 
 
407 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  27.54 
 
 
434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.8 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.9 
 
 
450 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.32 
 
 
455 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  25.44 
 
 
458 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1224  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.75 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249304  hitchhiker  0.000020369 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3290  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.75 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0140033  hitchhiker  0.000775175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1898  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.09 
 
 
443 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.75216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  25.44 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  25.44 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  25.44 
 
 
458 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  25.66 
 
 
454 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  24.73 
 
 
451 aa  125  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  25.44 
 
 
458 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.93 
 
 
443 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  25.44 
 
 
458 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  25.44 
 
 
458 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  24.29 
 
 
451 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.24 
 
 
485 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  23.77 
 
 
462 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  25.44 
 
 
454 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>