More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06020 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  100 
 
 		 444 aa  908    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  53.42 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  53.38 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0652  RNA methyltransferase, TrmA family  44.87 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000483498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  34.32 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  31.28 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.38 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  31.83 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  30.43 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  30.99 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  34.65 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  31.62 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  31.18 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  31.06 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  32.74 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  30.73 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  32.37 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  31.83 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  31.13 
 
 		 455 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  29.01 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  35.94 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  31.5 
 
 		 462 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  30.94 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  30.51 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  30.51 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  30.79 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  30.51 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  29.96 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  32.67 
 
 		 457 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  31.93 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  31.93 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  30.51 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  30.51 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.01 
 
 		 460 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  31.4 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  31.35 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  31.7 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  29.52 
 
 		 448 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  30.29 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.59 
 
 		 436 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  32.1 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  32.43 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  30.6 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  30.6 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  27.88 
 
 		 454 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  31.02 
 
 		 439 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.14 
 
 		 485 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  30.77 
 
 		 470 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  32.32 
 
 		 455 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  29.02 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  31.14 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  30.82 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.83 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  32.04 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  34.23 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.72 
 
 		 477 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.48 
 
 		 466 aa  190  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  32.51 
 
 		 428 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  29.16 
 
 		 470 aa  189  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.12 
 
 		 471 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  28.73 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  34.64 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  30.58 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  30.73 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  29.14 
 
 		 439 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  32.13 
 
 		 476 aa  186  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.55 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  29.33 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  29.89 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  29.05 
 
 		 471 aa  186  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  29.39 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.54 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  30.93 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  31.58 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.09 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  26.67 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  28.75 
 
 		 536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.8 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  29.66 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.43 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  31.98 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.99 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  29.52 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  30.02 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.41 
 
 		 411 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.37 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.02 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  29.52 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.3 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  29.3 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  29.3 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.8 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.36 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.3 
 
 		 459 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  29.4 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  29.4 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  30.79 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>