More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1636 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  100 
 
 
465 aa  920    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  77.05 
 
 
453 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  47.05 
 
 
490 aa  398  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  44.71 
 
 
455 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  44.15 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.45 
 
 
420 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.67 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  43.35 
 
 
415 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.76 
 
 
407 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  44.04 
 
 
405 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  44.62 
 
 
419 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  45.45 
 
 
447 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  41.99 
 
 
428 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.65 
 
 
449 aa  286  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.68 
 
 
387 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  40.09 
 
 
440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  39.64 
 
 
397 aa  259  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  42.41 
 
 
440 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  41.31 
 
 
399 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.5 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  37.42 
 
 
413 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40.05 
 
 
411 aa  236  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  40.67 
 
 
412 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  37.99 
 
 
488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  36.02 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.24 
 
 
433 aa  221  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  41.8 
 
 
417 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  38.18 
 
 
401 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  37.22 
 
 
422 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  36.67 
 
 
404 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  36.45 
 
 
404 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  36.45 
 
 
404 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  34.84 
 
 
405 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  35.91 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  35.63 
 
 
402 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  27.4 
 
 
405 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  33.92 
 
 
443 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  27.16 
 
 
460 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  24.51 
 
 
435 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  25.37 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.37 
 
 
444 aa  147  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  21.73 
 
 
473 aa  147  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  23.24 
 
 
446 aa  147  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.97 
 
 
455 aa  146  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  23.72 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  26.9 
 
 
397 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.27 
 
 
462 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1192  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.23 
 
 
468 aa  140  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  26.43 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  26.6 
 
 
456 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  23.75 
 
 
446 aa  136  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.66 
 
 
442 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.18 
 
 
441 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  25.59 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  48.57 
 
 
517 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  30.28 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1888  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.62 
 
 
392 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0458735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  28.6 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  30.63 
 
 
479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0352  RNA methyltransferase  29.25 
 
 
434 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  23.4 
 
 
454 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  23.58 
 
 
457 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  26.61 
 
 
436 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  26.77 
 
 
423 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  23.7 
 
 
419 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  24.32 
 
 
453 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.55 
 
 
449 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  27.36 
 
 
378 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  29.45 
 
 
461 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  24.04 
 
 
468 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  23.24 
 
 
453 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  25.42 
 
 
400 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0652  RNA methyltransferase, TrmA family  28.27 
 
 
441 aa  124  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000483498  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  28.34 
 
 
465 aa  123  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  26.22 
 
 
441 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  25.41 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.6 
 
 
449 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.17 
 
 
449 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  27.93 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  23.75 
 
 
458 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0927  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.96 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000132702  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4045  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.74 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000364507  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3089  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.96 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000243199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3088  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.64 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  23.75 
 
 
458 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  23.75 
 
 
458 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.05 
 
 
468 aa  120  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  23.75 
 
 
458 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  26.52 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  26.52 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.55 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0947  (Uracil-5)-methyltransferase  30.53 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  26.52 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  23.31 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  23.31 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  23.53 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  23.75 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.52 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.54 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  23.97 
 
 
458 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>