More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12704 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  66.08 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  66.08 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  66.08 
 
 
404 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  65.68 
 
 
402 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  65.83 
 
 
395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.94 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  41.77 
 
 
399 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.29 
 
 
407 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  39.76 
 
 
415 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  39.91 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  37.53 
 
 
455 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.29 
 
 
387 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  37.47 
 
 
442 aa  236  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  41.51 
 
 
447 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1888  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.96 
 
 
392 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0458735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  40.24 
 
 
419 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  37.18 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  36.82 
 
 
440 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.78 
 
 
449 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  37.44 
 
 
397 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.83 
 
 
440 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  37.44 
 
 
405 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.84 
 
 
465 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  39.81 
 
 
412 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.57 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  41.02 
 
 
417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  37.32 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  34.16 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  37.97 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  35.04 
 
 
413 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  34.67 
 
 
430 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  32.4 
 
 
490 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  36.81 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.22 
 
 
433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  31.99 
 
 
422 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.23 
 
 
436 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  27.88 
 
 
471 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  26.47 
 
 
397 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  24.56 
 
 
405 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  36.97 
 
 
517 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  23.47 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.21 
 
 
445 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.27 
 
 
455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  22.64 
 
 
435 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  22.88 
 
 
460 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  25.47 
 
 
424 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  26.46 
 
 
419 aa  106  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  21.66 
 
 
451 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  23.86 
 
 
446 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  31.79 
 
 
463 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  22.01 
 
 
419 aa  105  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  26.6 
 
 
407 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  26.07 
 
 
457 aa  104  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0590  RNA methyltransferase, TrmA family  27.17 
 
 
452 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  20.82 
 
 
446 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  23.31 
 
 
395 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  21.75 
 
 
468 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  26.22 
 
 
460 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  22.8 
 
 
457 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.77 
 
 
449 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0028  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.71 
 
 
434 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  24.66 
 
 
441 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.37 
 
 
450 aa  100  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  30.11 
 
 
446 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  32.2 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.47 
 
 
463 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.47 
 
 
463 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  23.65 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2239  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.38 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  23.31 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.53 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  24.76 
 
 
423 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.66 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.08 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  22.32 
 
 
449 aa  96.7  7e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0451  (Uracil-5)-methyltransferase  18.07 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.222179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  22.22 
 
 
454 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  24.59 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  20.97 
 
 
451 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  24.66 
 
 
457 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.23 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.59 
 
 
440 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0384  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.89 
 
 
516 aa  94  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397678  unclonable  0.000000000598014 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  23.23 
 
 
473 aa  93.6  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  26.8 
 
 
438 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  29.47 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  30.51 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  25.74 
 
 
446 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  24.94 
 
 
460 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  23.08 
 
 
415 aa  93.2  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  33.53 
 
 
479 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16911  predicted protein  25.51 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  25.26 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.69 
 
 
471 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  23.6 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1755  (Uracil-5)-methyltransferase  27.34 
 
 
391 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.38216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  29.08 
 
 
456 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  24.38 
 
 
461 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  24.38 
 
 
461 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>