More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2475 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2475  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 		 395 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.632436  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3925  (Uracil-5)-methyltransferase  81.86 
 
 		 402 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0169441  normal  0.531349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2199  deoxyribonuclease  71.9 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2245  deoxyribonuclease  71.9 
 
 		 404 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2188  deoxyribonuclease  72.15 
 
 		 404 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.179666  hitchhiker  0.00299032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12704  hypothetical protein  65.83 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1523  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  43.43 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24220  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  41.43 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.553679  normal  0.147194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2283  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.42 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.393981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2259  SAM-dependent methyltransferase related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase-like protein  40.94 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0876132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  39.56 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16200  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  39.17 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.808986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  38.31 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  38.53 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1888  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  44.53 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0458735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  38.61 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4525  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.13 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1396  RNA methyltransferase  37.97 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.671396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1715  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.7 
 
 		 449 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167025  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14530  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  38.95 
 
 		 440 aa  222  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1636  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.91 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1710  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  40.35 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1914  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  39.38 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1944  (Uracil-5)-methyltransferase  39.51 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  hitchhiker  0.00873961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1879  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  38.5 
 
 		 440 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1643  deoxyribonuclease  35.97 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1564  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  36.67 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.361248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1488  deoxyribonuclease  39.9 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.290236  normal  0.555959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2901  deoxyribonuclease  36.66 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1453  deoxyribonuclease  41.31 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1325  deoxyribonuclease/Rho related TRAM  36.04 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.367718  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1403  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  35.35 
 
 		 430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.075228  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15760  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  36.87 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.230124  normal  0.545948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3754  deoxyribonuclease/rho motif-related TRAM  33.97 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000020273  normal  0.148893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13050  SAM-dependent methyltransferase, tRNA(uracil-5)-methyltransferase  33.7 
 
 		 490 aa  173  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00461265  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0261  SAM-dependent methyltransferase  32.69 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0493  TRAM domain protein  29.28 
 
 		 471 aa  145  9e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.214175 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  27.73 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  23.8 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5189  deoxyribonuclease  44.23 
 
 		 517 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  26.12 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  24.13 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1065  RNA methyltransferase  22.86 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.929187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.44 
 
 		 449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  25.84 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  21.18 
 
 		 446 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.94 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2619  RNA methyltransferase  21.77 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0378  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.12 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0129185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  23 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.23 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.23 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  23.52 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  24.65 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0344  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.29 
 
 		 512 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  27.82 
 
 		 438 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf754  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  21.18 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0615  RNA methyltransferase  26.53 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  27.08 
 
 		 463 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  21.68 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0590  RNA methyltransferase, TrmA family  29.21 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  26.91 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  22.83 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  24.84 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  25.42 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  24.04 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  24.83 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  24.12 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  34 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.06 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.71 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  27.74 
 
 		 440 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.9 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3618  RNA methyltransferase  23.04 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.22847  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  22.81 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  22 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  22.62 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.12 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0678  RNA methyltransferase, TrmA family  19.57 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  23.7 
 
 		 453 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  25.05 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  23.52 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  28.29 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  23.2 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2194  RNA methyltransferase  24.49 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0138  (Uracil-5)-methyltransferase  24.72 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0850  RNA methyltransferase, TrmA family  27.03 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  23.29 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  28.97 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.12 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.29 
 
 		 443 aa  99.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0552  RNA methyltransferase  27.94 
 
 		 439 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  23.76 
 
 		 459 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  28.48 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  23.71 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  32.17 
 
 		 471 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_936  RNA methyltransferase, TrmA family  21.76 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0402  tRNA (Uracil-5-)-methyltransferase  26.73 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3145  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.69 
 
 		 450 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000412374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  28.18 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>