More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  100 
 
 		 441 aa  907    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  54.16 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  53.38 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0652  RNA methyltransferase, TrmA family  45 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000483498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 473 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0170  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  31.85 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  31.82 
 
 		 397 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2144  RNA methyltransferase  31.29 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.090086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1551  RNA methyltransferase  31.21 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000011157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.88 
 
 		 456 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  28.73 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  29.4 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1748  RNA methyltransferase  31.64 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  28.6 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  28.8 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  29.41 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.21 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  30.35 
 
 		 453 aa  196  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  30.35 
 
 		 453 aa  196  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  29.02 
 
 		 460 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1783  RNA methyltransferase  31.17 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  31.12 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  29.87 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  31.11 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.29 
 
 		 477 aa  193  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  31.15 
 
 		 536 aa  193  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  28.96 
 
 		 455 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.74 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  28.26 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  30.44 
 
 		 465 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1643  RNA methyltransferase, TrmA family  34.85 
 
 		 455 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0689931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  32.08 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  29.08 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  27.87 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  30.11 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0963  RNA methyltransferase, TrmA family  31.98 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.128465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  32.16 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.64 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.11 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.87 
 
 		 485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  27.99 
 
 		 456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  28.41 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6757  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.53 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  29.27 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  29.27 
 
 		 461 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  29.49 
 
 		 476 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.86 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.17 
 
 		 488 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  27.77 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  31.78 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.31 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  30.91 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  27.49 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.04 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2873  RNA methyltransferase, TrmA family  33.03 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.608612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  29.4 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  30.21 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2058  RNA methyltransferase, TrmA family  34.08 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.07 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1849  RNA methyltransferase, TrmA family  29.65 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1835  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.52 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  29.31 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  31.03 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.45 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  28.29 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  29.27 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2158  RNA methyltransferase, TrmA family  33.56 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  30.47 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  28.95 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  29.91 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  28.92 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.12 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  30.47 
 
 		 468 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.12 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.53 
 
 		 419 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  27.31 
 
 		 458 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  27.31 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.12 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  27.31 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1655  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.91 
 
 		 452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200595  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  27.13 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.02 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  29.24 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  28.73 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  27.09 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  29.25 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1734  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.45 
 
 		 450 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  27.09 
 
 		 454 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  27.31 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  27.09 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  28 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4063  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.68 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  30.07 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.09 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  28.74 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  29.66 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  27.09 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  27.09 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>