220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4072 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4072  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.860631  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2270  TetR family transcriptional regulator  80.4 
 
 		 200 aa  257  9e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  28.78 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.66 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  31.22 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  38.24 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  24.75 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 259 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3565  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0847285  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>