152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2270 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2270  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4072  TetR family transcriptional regulator  80.4 
 
 		 206 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.860631  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30.73 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  45 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  29.34 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 262 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6717  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.477187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 438 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>