More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2923 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2923  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  94.12 
 
 		 215 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3115  transcriptional regulator, TetR family  94.61 
 
 		 215 aa  359  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  35.42 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 420 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  49.18 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 388 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  47.17 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  38.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>