More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4366 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2923  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3115  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 72 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 390 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  35.87 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  47.17 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.52 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 273 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.63 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 266 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.97 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>