More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3115 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3115  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  410  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  96.74 
 
 		 215 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2923  TetR family transcriptional regulator  94.92 
 
 		 215 aa  349  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.38 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 125 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40.86 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 273 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  29.3 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 288 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 288 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 189 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 321 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 221 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 269 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  36.76 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>