154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0171 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  100 
 
 
826 aa  1715    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  95.88 
 
 
826 aa  1654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  32.19 
 
 
800 aa  398  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  32.51 
 
 
800 aa  398  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  31.54 
 
 
801 aa  380  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  31.13 
 
 
805 aa  362  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  31.82 
 
 
788 aa  360  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  31.29 
 
 
803 aa  358  1.9999999999999998e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.47 
 
 
803 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.18 
 
 
839 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.01 
 
 
793 aa  347  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.26 
 
 
804 aa  343  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  28.82 
 
 
835 aa  343  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.97 
 
 
805 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.08 
 
 
796 aa  339  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.14 
 
 
819 aa  330  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  29.33 
 
 
790 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  28.44 
 
 
823 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  27.57 
 
 
819 aa  323  7e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.58 
 
 
829 aa  319  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.9 
 
 
815 aa  319  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  27.95 
 
 
822 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  28.5 
 
 
822 aa  317  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  27.63 
 
 
830 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.35 
 
 
785 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.62 
 
 
821 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.25 
 
 
826 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.25 
 
 
826 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  26.54 
 
 
831 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.32 
 
 
826 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  26.54 
 
 
831 aa  303  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  27.37 
 
 
789 aa  297  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.49 
 
 
816 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  27.11 
 
 
789 aa  293  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  27 
 
 
797 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.8 
 
 
830 aa  273  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  25.36 
 
 
924 aa  250  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  25.73 
 
 
915 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  24.88 
 
 
922 aa  244  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  27.63 
 
 
915 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.79 
 
 
791 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  25.74 
 
 
752 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  28.36 
 
 
561 aa  213  1e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  24.59 
 
 
876 aa  213  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.2 
 
 
791 aa  211  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.66 
 
 
787 aa  211  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  23.96 
 
 
916 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.02 
 
 
849 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  24.37 
 
 
792 aa  197  9e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.48 
 
 
804 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  24.04 
 
 
788 aa  195  4e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.03 
 
 
857 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2821  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.24 
 
 
827 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.901669 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  23.84 
 
 
791 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  22.66 
 
 
791 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  24.48 
 
 
852 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  24.48 
 
 
852 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  21.51 
 
 
841 aa  137  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5465  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.91 
 
 
850 aa  136  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  decreased coverage  0.00704778 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  24.31 
 
 
852 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  25.1 
 
 
813 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  24.96 
 
 
816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2271  conjugal transfer ATPase TrbE  22.99 
 
 
812 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  24.61 
 
 
817 aa  127  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  25.64 
 
 
819 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0050  conjugal transfer protein TrbE  23.22 
 
 
845 aa  125  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30910  conjugal transfer ATPase TrbE  24.09 
 
 
817 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000414209  unclonable  1.71741e-21 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  26.53 
 
 
813 aa  125  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  24.23 
 
 
819 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  23.74 
 
 
817 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  25.9 
 
 
808 aa  124  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  23.86 
 
 
809 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  24.61 
 
 
816 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.25 
 
 
823 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.25 
 
 
823 aa  123  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5221  conjugal transfer ATPase TrbE  25 
 
 
819 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  25.83 
 
 
816 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  23.69 
 
 
824 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  21.93 
 
 
820 aa  120  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5609  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.21 
 
 
825 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.97 
 
 
816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  25.68 
 
 
814 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1319  conjugal transfer ATPase TrbE  25.29 
 
 
819 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.57 
 
 
817 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  25.66 
 
 
687 aa  118  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  25.09 
 
 
810 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  25.46 
 
 
825 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4566  conjugal transfer protein TrbE  22.99 
 
 
817 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0053  VirB4  22.55 
 
 
822 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.111502  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4747  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.76 
 
 
844 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290977 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5229  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  22.93 
 
 
846 aa  114  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.738503  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  22.43 
 
 
822 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  24.86 
 
 
840 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  24.18 
 
 
816 aa  112  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  26.17 
 
 
816 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  23.07 
 
 
854 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  22.84 
 
 
817 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.18 
 
 
840 aa  110  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  21.46 
 
 
811 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.18 
 
 
840 aa  110  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>