More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4465 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  38.38 
 
 		 1163 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  39.25 
 
 		 1162 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.52 
 
 		 1168 aa  665    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  45.21 
 
 		 1234 aa  886    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  38.1 
 
 		 1162 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  57.54 
 
 		 1170 aa  1218    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  57.28 
 
 		 1171 aa  1247    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  56.89 
 
 		 1170 aa  1195    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  79.22 
 
 		 1175 aa  1794    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  37.83 
 
 		 1162 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  47.49 
 
 		 1167 aa  908    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  56.89 
 
 		 1170 aa  1195    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  56.89 
 
 		 1170 aa  1196    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  57.7 
 
 		 1171 aa  1268    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  68.25 
 
 		 1175 aa  1555    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  46.68 
 
 		 1165 aa  897    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  79.05 
 
 		 1174 aa  1773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  56.8 
 
 		 1268 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  39.64 
 
 		 1162 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  65.08 
 
 		 1170 aa  1424    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  57.35 
 
 		 1170 aa  1222    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  56.8 
 
 		 1200 aa  1194    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  39.25 
 
 		 1162 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  49.53 
 
 		 1152 aa  989    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  44.41 
 
 		 1190 aa  883    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  56.8 
 
 		 1202 aa  1193    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  57.4 
 
 		 1170 aa  1210    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  57.82 
 
 		 1198 aa  1233    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  78.96 
 
 		 1174 aa  1757    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  41.26 
 
 		 1162 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  58.14 
 
 		 1206 aa  1213    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  74.72 
 
 		 1171 aa  1714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  37.64 
 
 		 1168 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  39.25 
 
 		 1162 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  43.31 
 
 		 1168 aa  790    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  72.4 
 
 		 1182 aa  1674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  57.57 
 
 		 1198 aa  1239    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  100 
 
 		 1175 aa  2313    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.34 
 
 		 1164 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  57.4 
 
 		 1171 aa  1259    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  58.04 
 
 		 1171 aa  1285    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  56.8 
 
 		 1170 aa  1193    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  57.75 
 
 		 1170 aa  1222    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  73.9 
 
 		 1181 aa  1654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  40.41 
 
 		 1162 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  57.12 
 
 		 1142 aa  1171    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  40.5 
 
 		 1162 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  39.22 
 
 		 1162 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  74.79 
 
 		 1171 aa  1666    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  75.74 
 
 		 1204 aa  1711    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  56.96 
 
 		 1172 aa  1207    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  57.83 
 
 		 1170 aa  1225    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  57.92 
 
 		 1170 aa  1223    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  50.21 
 
 		 1173 aa  1046    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  39.09 
 
 		 1162 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  36.5 
 
 		 1140 aa  625  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  35.49 
 
 		 1195 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 		 1164 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  37.97 
 
 		 1142 aa  626  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  37.87 
 
 		 1142 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  35.89 
 
 		 1169 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  39.07 
 
 		 1164 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  37.68 
 
 		 1142 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  40.23 
 
 		 1168 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  37.47 
 
 		 1167 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  36.87 
 
 		 1145 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 		 1145 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.47 
 
 		 1167 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.47 
 
 		 1167 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  36.12 
 
 		 1138 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  36.22 
 
 		 1138 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1164 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  36.14 
 
 		 1138 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  36.09 
 
 		 1138 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1164 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  35.38 
 
 		 1138 aa  592  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  34.81 
 
 		 1133 aa  589  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.19 
 
 		 1167 aa  588  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  38.8 
 
 		 1165 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  35.5 
 
 		 1144 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  36.13 
 
 		 1150 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  36.13 
 
 		 1150 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  34.21 
 
 		 1167 aa  488  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.13 
 
 		 1176 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  32.48 
 
 		 1176 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  32.18 
 
 		 1177 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.16 
 
 		 1175 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 		 1176 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 		 1187 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  28.15 
 
 		 1204 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.33 
 
 		 1173 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  28.54 
 
 		 1187 aa  399  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 		 1185 aa  396  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.94 
 
 		 1186 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.73 
 
 		 1178 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  35.1 
 
 		 1169 aa  365  2e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.63 
 
 		 1185 aa  366  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  32.18 
 
 		 1403 aa  360  9e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  28.98 
 
 		 1177 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  28.7 
 
 		 1170 aa  356  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>