147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10695 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 212 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  80 
 
 		 191 aa  307  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  81.72 
 
 		 192 aa  307  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  36.31 
 
 		 185 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 185 aa  95.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  35.67 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 185 aa  92  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  34.84 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  35.67 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  34.78 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  34.51 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  31.87 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  34.18 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  32.08 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  30.94 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 268 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  42.65 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  38.36 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  41.89 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.81 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 343 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  26.95 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 295 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>