181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6225 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 532 aa  1056    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  41.67 
 
 		 982 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  41.2 
 
 		 907 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 1137 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  28.06 
 
 		 1085 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 1085 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.23 
 
 		 1042 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.41 
 
 		 999 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.62 
 
 		 1058 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  28.21 
 
 		 1050 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  27.61 
 
 		 957 aa  103  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  27.73 
 
 		 1092 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  25.59 
 
 		 1141 aa  94  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  26.09 
 
 		 824 aa  93.6  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  27.93 
 
 		 792 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  29.79 
 
 		 1158 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  28.64 
 
 		 1087 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  28.27 
 
 		 1017 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  26.41 
 
 		 878 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  28.24 
 
 		 1227 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 1049 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  27.57 
 
 		 760 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 887 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  27.56 
 
 		 1036 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  25.5 
 
 		 701 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  27.51 
 
 		 799 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  28.7 
 
 		 776 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  29.82 
 
 		 1056 aa  78.2  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  26.97 
 
 		 818 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 886 aa  76.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  29.43 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 969 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 952 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  28.02 
 
 		 1066 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  27.67 
 
 		 1058 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  27.5 
 
 		 1125 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  28.53 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 765 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  28.32 
 
 		 777 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  26.88 
 
 		 1110 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 		 680 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  26.4 
 
 		 960 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10910  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  34.02 
 
 		 1392 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  32.74 
 
 		 1344 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 		 279 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 		 279 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  27.5 
 
 		 1102 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  34.56 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  32.08 
 
 		 2132 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 755 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  28.12 
 
 		 1119 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  25.96 
 
 		 1103 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1082 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.3 
 
 		 816 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 1186 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.37 
 
 		 1055 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  31.67 
 
 		 1749 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 1034 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  28.82 
 
 		 938 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  27.76 
 
 		 921 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  27.92 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 882 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11388  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.865645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 888 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 931 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 271 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  27.99 
 
 		 951 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 922 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  27.3 
 
 		 919 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  27.64 
 
 		 1097 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  26.42 
 
 		 1064 aa  63.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  27.7 
 
 		 943 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 779 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 972 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  21.04 
 
 		 812 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  28.22 
 
 		 1093 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11143  hypothetical protein  35.56 
 
 		 164 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  31.69 
 
 		 462 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 633 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  27.25 
 
 		 943 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  30 
 
 		 658 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.43 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  32.82 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  26.4 
 
 		 1018 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 775 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 1079 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.13 
 
 		 1105 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  26.8 
 
 		 1049 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1780  putative adenylate/guanylate cyclase  36.71 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 799 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  24.17 
 
 		 950 aa  58.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  25.96 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>