287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2833 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4392  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  30.07 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  31.51 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  53.19 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  40.28 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.41 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4072  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.860631  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  42.62 
 
 		 71 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  28.4 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  57.5 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 438 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  51.22 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.64 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.79 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>