More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1412 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1373  diguanylate cyclase  99.82 
 
 		 557 aa  1140    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.949847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2870  diguanylate cyclase  80.43 
 
 		 555 aa  904    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1570  GGDEF domain-containing protein  79.53 
 
 		 555 aa  917    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3445  diguanylate cyclase  59.33 
 
 		 556 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.358514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1412  diguanylate cyclase  100 
 
 		 557 aa  1143    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.814955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1389  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  97.85 
 
 		 557 aa  1067    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2970  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  98.38 
 
 		 557 aa  1127    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2700  diguanylate cyclase  77.36 
 
 		 555 aa  865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.418522  hitchhiker  0.000139033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2768  diguanylate cyclase  78.44 
 
 		 555 aa  877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.137361  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1084  GGDEF domain-containing protein  60.69 
 
 		 562 aa  626  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.287669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3296  diguanylate cyclase  60.72 
 
 		 507 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000430363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2961  diguanylate cyclase  51.41 
 
 		 565 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  29.62 
 
 		 603 aa  141  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  27.33 
 
 		 612 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  24.63 
 
 		 564 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.44 
 
 		 867 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4293  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 		 1011 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.291525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  27.09 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  22.67 
 
 		 588 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  28.39 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  25.33 
 
 		 611 aa  97.4  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  25.17 
 
 		 631 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  24.88 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  25.9 
 
 		 565 aa  91.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2484  GGDEF domain-containing protein  24.44 
 
 		 571 aa  90.9  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  25.12 
 
 		 614 aa  89.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  26.25 
 
 		 566 aa  89  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  23.79 
 
 		 638 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  23.44 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3341  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 655 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  23.64 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  30.7 
 
 		 660 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 227 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0308  diguanylate cyclase  26.97 
 
 		 581 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0313  diguanylate cyclase  26.48 
 
 		 577 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1663  diguanylate cyclase  28.19 
 
 		 491 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2916  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  32.54 
 
 		 543 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.833203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3711  diguanylate cyclase  26.72 
 
 		 571 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3210  GGDEF domain-containing protein  22.74 
 
 		 624 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.58 
 
 		 1264 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0259  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  25.06 
 
 		 630 aa  80.5  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0437  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 628 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0211155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0600  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.98 
 
 		 669 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  25.51 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  25.51 
 
 		 625 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3407  translation initiation factor IF-2  38 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60542  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0411  diguanylate cyclase  24.64 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3903  periplasmic/7TM domain sensor diguanylate cyclase  24.24 
 
 		 628 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0423  diguanylate cyclase  24.5 
 
 		 621 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  22.26 
 
 		 625 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.63 
 
 		 868 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2970  diguanylate cyclase  25.06 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.853836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  25.65 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.59 
 
 		 1466 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  23.92 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  29.27 
 
 		 624 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 625 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0347  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  28 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  27.65 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  27.06 
 
 		 738 aa  77.4  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  25.24 
 
 		 601 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  25.67 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1721  diguanylate cyclase  30.38 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0930  diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1815  diguanylate cyclase  28.29 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.404044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.75 
 
 		 557 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.21 
 
 		 582 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3603  GGDEF domain-containing protein  29.19 
 
 		 570 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.38 
 
 		 550 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  25.31 
 
 		 716 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.46 
 
 		 853 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0485  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  34.15 
 
 		 1011 aa  75.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1537  diguanylate cyclase  28.72 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7641  hypothetical protein  33.97 
 
 		 655 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1162  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.7 
 
 		 587 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  30.41 
 
 		 641 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2678  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.9 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1679  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.53 
 
 		 1050 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  31.21 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2370  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  29.15 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  22.88 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3693  response regulator receiver domain-containing protein  29.31 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.963643  normal  0.0549661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.99 
 
 		 1078 aa  74.7  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1688  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1827  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.06 
 
 		 569 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0440  hypothetical protein  28.93 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0645  diguanylate cyclase  26.37 
 
 		 659 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1927  sensory box/response regulator  31.43 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.19 
 
 		 1251 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5509  GGDEF domain protein  30.86 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  28.34 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  31.48 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  33.55 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3853  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  30.53 
 
 		 638 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3754  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 512 aa  73.6  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>