141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0992 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  44.71 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 246 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  29.29 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  33.05 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  44 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 221 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 220 aa  44.7  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  47.27 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  43.4 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  43.64 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.85 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 263 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 215 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 179 aa  42  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>