More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1015 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 1216 aa  2437    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.27 
 
 		 1029 aa  167  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.26 
 
 		 713 aa  150  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.47 
 
 		 1034 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.07 
 
 		 1055 aa  147  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.19 
 
 		 1067 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.95 
 
 		 1056 aa  132  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.65 
 
 		 1013 aa  127  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.36 
 
 		 1075 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 1116 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  28.77 
 
 		 1109 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  27.42 
 
 		 494 aa  117  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  24.98 
 
 		 1183 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27 
 
 		 1193 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.96 
 
 		 1126 aa  111  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  26.52 
 
 		 1163 aa  110  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  26.43 
 
 		 1118 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  26.57 
 
 		 1118 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  24.27 
 
 		 1139 aa  108  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.96 
 
 		 1190 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 1089 aa  107  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30 
 
 		 1044 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 1064 aa  99.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  27.89 
 
 		 1145 aa  94.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 1050 aa  94.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.03 
 
 		 1143 aa  92  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.59 
 
 		 1227 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1141 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 1141 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  29.21 
 
 		 991 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 1141 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  23.8 
 
 		 1148 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.13 
 
 		 1175 aa  82.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  30.83 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.67 
 
 		 999 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  23.63 
 
 		 1048 aa  79.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 973 aa  79.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 992 aa  79  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.38 
 
 		 1160 aa  78.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 		 992 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.77 
 
 		 1295 aa  77.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  32.2 
 
 		 689 aa  76.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.64 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 636 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 900 aa  73.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 648 aa  73.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  26.88 
 
 		 900 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 957 aa  72  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  29.59 
 
 		 1097 aa  72  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.6 
 
 		 1360 aa  70.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  26 
 
 		 1083 aa  70.1  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 1403 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  26.32 
 
 		 1094 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 		 1198 aa  69.3  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  24.28 
 
 		 911 aa  69.3  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  25.04 
 
 		 1141 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 932 aa  69.3  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 1015 aa  69.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.74 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  27.14 
 
 		 964 aa  68.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.14 
 
 		 1111 aa  68.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.16 
 
 		 1441 aa  68.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 921 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  25.31 
 
 		 921 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.14 
 
 		 1003 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  26.02 
 
 		 1083 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  26.06 
 
 		 921 aa  66.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  25.31 
 
 		 921 aa  66.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1450 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.81 
 
 		 967 aa  66.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  26.97 
 
 		 1145 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.21 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  24.91 
 
 		 1095 aa  65.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  26.77 
 
 		 1101 aa  65.1  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  27.16 
 
 		 855 aa  65.1  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  27.34 
 
 		 963 aa  64.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  25.08 
 
 		 996 aa  64.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.42 
 
 		 1291 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  27.11 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  26.59 
 
 		 1061 aa  62.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  25.13 
 
 		 1114 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  28.68 
 
 		 947 aa  62.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  28.96 
 
 		 921 aa  62.4  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  22.22 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  27.87 
 
 		 983 aa  62  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 		 1000 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  23.07 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.29 
 
 		 1105 aa  61.6  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 1235 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.03 
 
 		 1147 aa  61.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  28.35 
 
 		 1030 aa  60.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 		 952 aa  60.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  27.55 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.42 
 
 		 1204 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  27.48 
 
 		 1097 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.24 
 
 		 1914 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.3 
 
 		 572 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 		 1050 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.42 
 
 		 1050 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  25.71 
 
 		 919 aa  60.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>