More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2328 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  100 
 
 		 404 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  93.6 
 
 		 405 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.46 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.67 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.92 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.28 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  33.51 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.53 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.05 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.66 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.85 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  34.86 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.17 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.43 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.29 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.77 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.15 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.27 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  34.27 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.57 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.94 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.01 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  34.77 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  32.6 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.27 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  29.4 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.31 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.93 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.35 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  28.24 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.3 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.26 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.65 
 
 		 405 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.52 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.69 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  33.42 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.94 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.9 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.2 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.03 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.75 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.76 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.78 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.29 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.7 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  27.75 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  32.01 
 
 		 400 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
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NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.71 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.92 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  29.44 
 
 		 396 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.57 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.37 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.55 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.77 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  28.15 
 
 		 425 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.5 
 
 		 408 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.27 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.04 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.67 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  31.38 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  29.11 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.59 
 
 		 389 aa  136  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.45 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.19 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  29.23 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.52 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  25.26 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  22.94 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  25.26 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  25.26 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  25.26 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  25.26 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  24.54 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.34 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.34 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.33 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.53 
 
 		 396 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.53 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.5 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.18 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.27 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  27.96 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  32.56 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.47 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  24.68 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.99 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  28.96 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.97 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.37 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.94 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.97 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.33 
 
 		 302 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.45 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  31.09 
 
 		 384 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.35 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  29.43 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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