More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4143 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  100 
 
 		 479 aa  954    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  95.41 
 
 		 479 aa  891    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  62.87 
 
 		 476 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  63.5 
 
 		 475 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  61.97 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  59.24 
 
 		 486 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  51.97 
 
 		 478 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  53.14 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  51.93 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  54.18 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  51.02 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  52.17 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  50 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  44.39 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  44.13 
 
 		 444 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  43.88 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.47 
 
 		 727 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  37.66 
 
 		 785 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  39.02 
 
 		 1631 aa  163  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  31.7 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  35.84 
 
 		 1134 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  34.45 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  34.45 
 
 		 531 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  31.82 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  33.12 
 
 		 648 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.04 
 
 		 1133 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.21 
 
 		 820 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  31.79 
 
 		 745 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  29.1 
 
 		 513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  35.69 
 
 		 535 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  36.14 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  32.39 
 
 		 606 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  34.69 
 
 		 713 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  34.35 
 
 		 713 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  32.64 
 
 		 1112 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.41 
 
 		 928 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  31.84 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  28.45 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  33.19 
 
 		 1112 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  42.5 
 
 		 2133 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  42.5 
 
 		 2198 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  41.98 
 
 		 1037 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  40.15 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 2701 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  46.46 
 
 		 856 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  36.48 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  38.73 
 
 		 2467 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.53 
 
 		 2812 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  28.92 
 
 		 681 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  30.77 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.63 
 
 		 861 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  51.25 
 
 		 2524 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.3 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.6 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.55 
 
 		 4836 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.46 
 
 		 1180 aa  70.1  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  44.23 
 
 		 2768 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.9 
 
 		 1269 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  36.15 
 
 		 2743 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  36.02 
 
 		 1610 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.25 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.9 
 
 		 1269 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  43.81 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 		 907 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  39.18 
 
 		 2097 aa  66.6  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  47.01 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  46.84 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.43 
 
 		 2678 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  34.87 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  35.58 
 
 		 1610 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  32.72 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  32.84 
 
 		 1572 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  31.45 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  46.15 
 
 		 1019 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  46.38 
 
 		 1883 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  41.32 
 
 		 998 aa  64.3  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  35.1 
 
 		 867 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  45.65 
 
 		 1650 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  51.43 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.14 
 
 		 1839 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  36.29 
 
 		 6211 aa  63.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.16 
 
 		 1403 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  42.67 
 
 		 2890 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  41.41 
 
 		 768 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.34 
 
 		 5839 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  41.35 
 
 		 4214 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.35 
 
 		 5787 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 2885 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  42.31 
 
 		 4285 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  42.39 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  43.18 
 
 		 1286 aa  60.5  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 2239 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  38.39 
 
 		 12741 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  37.68 
 
 		 1202 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  43.42 
 
 		 2125 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>