More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5353 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  73.96 
 
 		 179 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  68.64 
 
 		 177 aa  245  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  65.09 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  63.43 
 
 		 181 aa  238  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  68.1 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  67.48 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  59.51 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  54.34 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  51.74 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  51.95 
 
 		 176 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  46.71 
 
 		 181 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  49.03 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  50.66 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  48.78 
 
 		 181 aa  144  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  48.08 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  49.67 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  49.34 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  45.62 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  47.85 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  43.71 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  44.3 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  44.94 
 
 		 167 aa  127  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  42.86 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  43.59 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.7 
 
 		 178 aa  125  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  44.3 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  40.94 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  39.53 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  39.05 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  42.86 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  43.24 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  39.08 
 
 		 209 aa  121  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  43.51 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  39.77 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  43.29 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  41.76 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  43.29 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  41.98 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  37.28 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  39.51 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.79 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  42.14 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  39.07 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  42.48 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  38.56 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  40.49 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  38.82 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  39.52 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  39.52 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  38.96 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40.4 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  40.24 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  45.65 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  39.29 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  41.83 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  39.29 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  42.76 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.26 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  45.65 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  38.96 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  42.28 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  44.93 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.89 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  44.72 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  39.62 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  39.29 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  38.65 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  40.79 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  40.27 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  39.31 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  42.21 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  38.16 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.75 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  43.23 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.65 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  42.07 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  41.72 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  39.07 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>