More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1895 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  37.26 
 
 		 1063 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  38.55 
 
 		 1034 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 		 1063 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.92 
 
 		 1060 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  37.26 
 
 		 1063 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.02 
 
 		 1041 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.79 
 
 		 1067 aa  717    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  42.86 
 
 		 1052 aa  803    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1053 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1049 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  42.47 
 
 		 1121 aa  809    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  41.32 
 
 		 1032 aa  778    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  37.62 
 
 		 1039 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  38.18 
 
 		 1042 aa  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1063 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  37.24 
 
 		 1044 aa  697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  44.99 
 
 		 1038 aa  784    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1067 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 		 1067 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 		 1050 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1051 aa  2107    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1067 aa  703    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  36.48 
 
 		 1055 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  37.64 
 
 		 1048 aa  701    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.61 
 
 		 1067 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  37.92 
 
 		 1063 aa  731    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1073 aa  628  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.22 
 
 		 1060 aa  626  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1060 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1057 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.38 
 
 		 1074 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1053 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1068 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  34.62 
 
 		 1056 aa  589  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  35.7 
 
 		 1060 aa  592  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1061 aa  591  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  37.09 
 
 		 1075 aa  582  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1052 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1041 aa  579  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  33.33 
 
 		 1050 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1062 aa  568  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.49 
 
 		 1093 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1066 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.52 
 
 		 1054 aa  566  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1069 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1033 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1074 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1041 aa  538  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1098 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1050 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1072 aa  512  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1033 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1053 aa  506  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1043 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.47 
 
 		 1034 aa  502  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1040 aa  492  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1036 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.64 
 
 		 1053 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1054 aa  485  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.89 
 
 		 1048 aa  481  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1063 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1035 aa  482  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1035 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1048 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  30 
 
 		 1071 aa  478  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1054 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1030 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1033 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1064 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1131 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  31.53 
 
 		 1135 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1137 aa  373  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1044 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1035 aa  344  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1043 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1044 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1030 aa  336  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1043 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1092 aa  333  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1032 aa  333  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1058 aa  332  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1034 aa  332  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1043 aa  330  9e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1095 aa  329  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1070 aa  326  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1017 aa  326  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 1496 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1470 aa  325  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1028 aa  325  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1041 aa  323  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  25.6 
 
 		 1041 aa  320  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.17 
 
 		 1069 aa  319  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1011 aa  318  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1034 aa  316  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1028 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.48 
 
 		 1049 aa  315  3.9999999999999997e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1039 aa  313  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>