282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2866 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  53.43 
 
 
275 aa  291  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  29.12 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  29.3 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  29.33 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  26.55 
 
 
281 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  25.63 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  29.6 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.04 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  24.74 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  26.72 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  29.91 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  29.64 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.8 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  28.16 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.41 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  27.87 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.21 
 
 
147 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  25.76 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.76 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  28.63 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  29.01 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.54 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  27.97 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  27.54 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  23.83 
 
 
276 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  34.12 
 
 
162 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.89 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  29.5 
 
 
149 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.87 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.45 
 
 
154 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  34.31 
 
 
138 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  26.56 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.05 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  25.6 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.18 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  24.21 
 
 
284 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.99 
 
 
139 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 
145 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.87 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  27.73 
 
 
300 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  23.79 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  24.89 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 
128 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 
150 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  26.71 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  23.66 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
138 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  25.63 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  24.47 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  27.57 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  31.78 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  24.39 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  24.76 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
139 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  24.88 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.78 
 
 
138 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  25.91 
 
 
390 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  39.68 
 
 
129 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  20.95 
 
 
283 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.08 
 
 
151 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.84 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  25.28 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.53 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
145 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  25.21 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.09 
 
 
140 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  27.35 
 
 
352 aa  52.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.88 
 
 
139 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.57 
 
 
149 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  27.23 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.66 
 
 
145 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  30 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
143 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  26.82 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 
292 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  25.19 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  32.1 
 
 
175 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  32.39 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  25.94 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  24.78 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.45 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  28.74 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  26.38 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  28.74 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>