More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2095 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 325 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 220 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  32.29 
 
 		 238 aa  94.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  31.78 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  33.8 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  42.19 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.14 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  33.75 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  44.23 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  40.98 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  31 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1663  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.319165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>