More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0901 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  100 
 
 		 752 aa  1486    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  46.4 
 
 		 752 aa  706    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  41.14 
 
 		 756 aa  634  1e-180  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  42.78 
 
 		 758 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  41.22 
 
 		 746 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  38.78 
 
 		 747 aa  592  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  39.27 
 
 		 777 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  38.95 
 
 		 777 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  32.89 
 
 		 812 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  31.35 
 
 		 748 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  33.88 
 
 		 755 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  30.97 
 
 		 778 aa  355  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  27.89 
 
 		 864 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.98 
 
 		 687 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.7 
 
 		 821 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  25.58 
 
 		 889 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.41 
 
 		 865 aa  155  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.88 
 
 		 764 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  28.65 
 
 		 385 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28.18 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.09 
 
 		 380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.11 
 
 		 385 aa  129  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.73 
 
 		 773 aa  124  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.4 
 
 		 831 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  24.95 
 
 		 1359 aa  121  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.96 
 
 		 1204 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.95 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.64 
 
 		 895 aa  111  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  25.63 
 
 		 387 aa  110  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  24.22 
 
 		 923 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  24.79 
 
 		 921 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.32 
 
 		 1011 aa  102  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  24.09 
 
 		 805 aa  99.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.55 
 
 		 905 aa  97.8  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.03 
 
 		 806 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.98 
 
 		 807 aa  94.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.41 
 
 		 788 aa  94.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.07 
 
 		 815 aa  94  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.52 
 
 		 796 aa  92  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.95 
 
 		 788 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  22 
 
 		 785 aa  91.3  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.32 
 
 		 874 aa  89.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.61 
 
 		 788 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.24 
 
 		 1051 aa  89.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.54 
 
 		 808 aa  87.8  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.05 
 
 		 756 aa  87  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  24.31 
 
 		 779 aa  86.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  20.96 
 
 		 789 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.61 
 
 		 797 aa  84.3  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.28 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  23.9 
 
 		 842 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.43 
 
 		 816 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  20.78 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 811 aa  83.2  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.64 
 
 		 778 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.22 
 
 		 861 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  22.74 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  22.41 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22.91 
 
 		 872 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  21.8 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  21.8 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.34 
 
 		 767 aa  76.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  23.39 
 
 		 733 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.77 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  20.85 
 
 		 764 aa  73.9  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.11 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.9 
 
 		 821 aa  72  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  25.89 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  19.69 
 
 		 779 aa  70.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  23.04 
 
 		 786 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  20.51 
 
 		 786 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  20.51 
 
 		 786 aa  70.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  22.46 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  22.63 
 
 		 1155 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.26 
 
 		 801 aa  68.6  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.88 
 
 		 835 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  23.44 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  21.24 
 
 		 787 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  21.86 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.05 
 
 		 832 aa  68.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  23.86 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.87 
 
 		 872 aa  67.8  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  24.39 
 
 		 783 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  21.77 
 
 		 981 aa  67.4  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.94 
 
 		 724 aa  67.4  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.29 
 
 		 829 aa  67.4  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.29 
 
 		 829 aa  67.4  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  22.56 
 
 		 974 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  24.21 
 
 		 731 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  24.65 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  22.53 
 
 		 766 aa  67.4  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  21.08 
 
 		 804 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  22.12 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.38 
 
 		 1109 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  24.56 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.56 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.73 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  21.63 
 
 		 799 aa  66.6  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>