More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2226 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  66.67 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  48.39 
 
 		 189 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  46.2 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  47.37 
 
 		 193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  41.8 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  41.11 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  39.35 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 172 aa  91.7  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  30.53 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  31.91 
 
 		 389 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  35.5 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 236 aa  87.8  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  30.41 
 
 		 213 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 240 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  33.97 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  33.53 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 232 aa  84.7  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  32.18 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.98 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  36.05 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  30.6 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  32.18 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  29.94 
 
 		 247 aa  80.9  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.49 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  32.02 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  31.43 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2022  isochorismatase hydrolase  34.52 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85317  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  33.57 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  28.57 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  32.2 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  35.26 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  30.35 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.81 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6845  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.356224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  30.59 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  26.79 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.06 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.75 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.64 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2001  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2611  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2531  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.736138 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5517  isochorismatase hydrolase  27.55 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.843237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.77 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  26.21 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2658  isochorismatase hydrolase  27.92 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  29.31 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  31.52 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5942  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  30.2 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.28 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>