More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0538 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  80.86 
 
 
381 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  100 
 
 
373 aa  773    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  79.78 
 
 
387 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  79.25 
 
 
382 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  75.07 
 
 
380 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  67.11 
 
 
385 aa  539  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  67.02 
 
 
372 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  65.24 
 
 
405 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  65.58 
 
 
373 aa  518  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  63.37 
 
 
376 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  64.5 
 
 
373 aa  509  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  64.46 
 
 
370 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  66.38 
 
 
370 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  64.48 
 
 
378 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  67.24 
 
 
370 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  64.35 
 
 
370 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  63.49 
 
 
388 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  65.24 
 
 
370 aa  494  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  65.24 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  65.53 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  65.53 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  65.53 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  63.84 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  65.24 
 
 
370 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  64.01 
 
 
370 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  64.01 
 
 
370 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  64.01 
 
 
370 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  63.01 
 
 
370 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  62.74 
 
 
378 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  63.01 
 
 
378 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  62.47 
 
 
378 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  62.57 
 
 
377 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  62.19 
 
 
378 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  59.68 
 
 
376 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  63.32 
 
 
370 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  59.14 
 
 
376 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  61.92 
 
 
378 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  62.19 
 
 
378 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  61.48 
 
 
379 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  61.48 
 
 
379 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  63.34 
 
 
378 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  61.1 
 
 
379 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  61.37 
 
 
378 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  61.2 
 
 
381 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  61.48 
 
 
379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  59.5 
 
 
375 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  58.92 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  61.16 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  60 
 
 
378 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  60.05 
 
 
381 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  58.9 
 
 
378 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  58.63 
 
 
378 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  59.24 
 
 
390 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  56.22 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  59.39 
 
 
372 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  57.3 
 
 
368 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  60.34 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  57.8 
 
 
390 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  56.84 
 
 
368 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  58.29 
 
 
368 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  58.57 
 
 
368 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  54.24 
 
 
373 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  56.9 
 
 
376 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  56.45 
 
 
371 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  56.9 
 
 
376 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  54.24 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  53.72 
 
 
389 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  53.95 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  53.85 
 
 
370 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  53.87 
 
 
397 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  54.24 
 
 
409 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  53.85 
 
 
375 aa  391  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  50.13 
 
 
402 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  50.7 
 
 
377 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  51 
 
 
364 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  51 
 
 
384 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  49.58 
 
 
375 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  48.33 
 
 
372 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  48 
 
 
390 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  46.49 
 
 
387 aa  355  5.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  48.14 
 
 
395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  48.99 
 
 
376 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  46.37 
 
 
401 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  49.58 
 
 
392 aa  339  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  47.24 
 
 
389 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  46.65 
 
 
388 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2855  type II secretion system protein E  71.43 
 
 
247 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000216889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  45.88 
 
 
387 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  45.88 
 
 
387 aa  332  9e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  44.54 
 
 
380 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  44.5 
 
 
382 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  42.33 
 
 
368 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  43.85 
 
 
404 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  42.86 
 
 
366 aa  322  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  46.29 
 
 
388 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  45.68 
 
 
395 aa  318  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  44.47 
 
 
387 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  42.98 
 
 
366 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  42.86 
 
 
365 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  42.42 
 
 
366 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>