210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2545 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 442 aa  897    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  31.01 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.51 
 
 		 443 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 447 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.89 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.89 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  24.7 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2042  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 483 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.8 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.35 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  23.36 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.87 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.55 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.95 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.1 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.76 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.22 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 925 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0126  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0473  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.49 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 443 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.68 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 435 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>