160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1896 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  100 
 
 		 434 aa  816    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  56.14 
 
 		 398 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  47.41 
 
 		 407 aa  256  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  45.85 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7392  putative transcriptional regulator, PucR family  42.52 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 526 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  33.43 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  26.67 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.11 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  29.59 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4276  CdaR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.416478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  26.42 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.65 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  32.41 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  20.54 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  20 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  19.57 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  21.02 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  34.01 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  47.62 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  21.79 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  33.81 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  20 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  36.17 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  40.41 
 
 		 399 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  40.19 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  19.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  19.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  19.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  19.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.77 
 
 		 645 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  35.23 
 
 		 644 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  20.83 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  34.01 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1045  transcriptional regulator, CdaR  18.77 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  39.22 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  28.73 
 
 		 525 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  28.01 
 
 		 405 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  28.7 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  39.42 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  26.86 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.38 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  27.89 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 558 aa  53.1  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 372 aa  53.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  29.67 
 
 		 648 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1836  CdaR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  37.5 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35.87 
 
 		 557 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  37.76 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  28.47 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  38.78 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  31.91 
 
 		 553 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  22.95 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.44 
 
 		 493 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  40.82 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  36.79 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  30.36 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  37.76 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 597 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1382  transcriptional regulator, CdaR  29 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  28.36 
 
 		 478 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  39.05 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  48 
 
 		 543 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  21.74 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  32.46 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  29.46 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.39 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  37.33 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.29 
 
 		 555 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 477 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1897  transcriptional regulator, CdaR  18.87 
 
 		 381 aa  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  33.99 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  31.46 
 
 		 639 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  39.36 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  21.62 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  30.24 
 
 		 510 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  35.71 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  27.46 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  44.83 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  24.14 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  30.62 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.7 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.7 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  36.21 
 
 		 600 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4926  transcriptional regulator, CdaR  39.39 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  33.33 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>