175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3899 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3899  secretion protein HlyD  100 
 
 		 485 aa  921    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553223 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3065  secretion protein HlyD  48.97 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.757879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3080  efflux transporter  51.75 
 
 		 487 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4484  RND family efflux transporter MFP subunit  24.74 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.43 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  29.71 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3598  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  25.16 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06540  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0259  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1448  RND family efflux transporter MFP subunit  23.14 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00133129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  0.756916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 		 418 aa  67  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148727  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  28.1 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1841  secretion protein HlyD  25.13 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1711  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1894  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2178  RND family efflux transporter MFP subunit  22.86 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.569446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.506027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0404  RND family efflux transporter MFP subunit  21.62 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0540732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2937  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0108  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.03 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.1 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2743  hypothetical protein  24.93 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2010  RND family efflux transporter MFP subunit  21.68 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.397997  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2379  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0659  RND family efflux transporter MFP subunit  21.96 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3096  membrane-fusion protein  23.18 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.651787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  27.37 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2167  RND family efflux transporter MFP subunit  22.66 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2468  RND family efflux transporter MFP subunit  21.45 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17063  normal  0.298309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  26.88 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0766  RND family efflux transporter MFP subunit  22.58 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  30.62 
 
 		 330 aa  57  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  27.23 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0379  hypothetical protein  24.1 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  27.47 
 
 		 378 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02659  putative multidrug resistance protein  23.33 
 
 		 379 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196626  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  30.13 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 388 aa  54.3  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.53 
 
 		 448 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  26.4 
 
 		 426 aa  53.5  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  31.03 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3933  ATP synthase F1, beta subunit  33.98 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  28.31 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  24.94 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6347  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.98 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  24.64 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4863  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.73 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3902  RND family efflux transporter MFP subunit  30.39 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.538028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  28.14 
 
 		 379 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.57 
 
 		 367 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  28.26 
 
 		 390 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3162  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000420577  unclonable  0.00000105041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0537  HlyD family multidrug resistance protein  23.35 
 
 		 381 aa  50.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.996753  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 357 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3894  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366041 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0668  Acr family membrane-fusion protein  23.31 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  28.57 
 
 		 349 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  30.47 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1849  putative RND efflux system protein, MFP subunit  25.67 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2117  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.893928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1058  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 406 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4262  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  25.97 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0329  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 289 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  26.56 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  27.85 
 
 		 350 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  24.39 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  23.02 
 
 		 368 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  30.84 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  29.84 
 
 		 386 aa  48.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  26.28 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25.17 
 
 		 370 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  26.28 
 
 		 388 aa  47.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2953  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 360 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  26.27 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00999  Membrane-fusion protein  23.22 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  26.27 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 		 352 aa  47.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  26.23 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  26.73 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.43 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>