More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3162 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3162  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 389 aa  778    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000420577  unclonable  0.00000105041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  44.27 
 
 		 392 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  47.4 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0777  RND family efflux transporter MFP subunit  45.29 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.12 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00182  acriflavine resistance protein a precursor  43.15 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  43.62 
 
 		 405 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.27 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.22 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  45.22 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  44.44 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  45.53 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  44.17 
 
 		 442 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  44.35 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.12 
 
 		 433 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  41.78 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  46.18 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  45.56 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  47.42 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  44.66 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  49.07 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  45.66 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  44.08 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  45.4 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  43.91 
 
 		 386 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.13 
 
 		 399 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  43.22 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  44.9 
 
 		 401 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  46.29 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.31 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  43.63 
 
 		 386 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  42.82 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  42.55 
 
 		 418 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  44.03 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  45.72 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  44.93 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  44.21 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  44.51 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  42.42 
 
 		 390 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.03 
 
 		 446 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  41.49 
 
 		 428 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  42.94 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  42.94 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  45.27 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  42.94 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  43.49 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  44.25 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  42.7 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 385 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  43.7 
 
 		 386 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  47.88 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  43.34 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  43.9 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.59 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  43.87 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  43.86 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  44.89 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  43.62 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0327  RND family efflux transporter MFP subunit  43.66 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.66 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.97 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.32 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  43.32 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  44.06 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  43.03 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  40.7 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  42.78 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.4 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  41.99 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.78 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  44.81 
 
 		 409 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.41 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  43.49 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.81 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  43.03 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  43.03 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  43.03 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  43.03 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  43.03 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  41.13 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  44.35 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.53 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  42.29 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  40.76 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.79 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  41.81 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4025  RND family efflux transporter MFP subunit  44.38 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.259915 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  39.55 
 
 		 397 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  41.81 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  39.27 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  39.27 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  39.27 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  39.27 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  42.94 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  39.27 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  41.52 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>