226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3808 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 434 aa  880    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 		 474 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.86 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 421 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 		 424 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 421 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.08 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1560  urea ABC transporter, substrate-binding protein  37.32 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.3 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  23.46 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  32.65 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1440  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  34.58 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  25.96 
 
 		 394 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  28.71 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  35.92 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  22.85 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  22.78 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  20.75 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  22.08 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  23.1 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  23.9 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 		 394 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  24.45 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5345  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040092  normal  0.403221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0942  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  29.63 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.06 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1019  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  33.63 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  22.42 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  35.09 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  35.14 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  22.9 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.89 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  21.39 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0563  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  32.06 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  26.22 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.51 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  22.75 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.78 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  22.07 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  35.63 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.84 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7438  ABC transporter substrate-binding protein  22.93 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  35.53 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  20.54 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  29.84 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3202  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  31.13 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.836908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>