More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3236 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3236  MATE efflux family protein  100 
 
 		 502 aa  965    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  54.2 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3886  MATE efflux family protein  51.04 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  50.4 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4468  MATE efflux family protein  49.79 
 
 		 481 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1672  MATE efflux family protein  50.1 
 
 		 498 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3461  MATE efflux family protein  43.16 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1498  MATE efflux family protein  43.64 
 
 		 478 aa  291  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  36.52 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  35.65 
 
 		 498 aa  220  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.81 
 
 		 475 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  23.3 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 475 aa  113  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1362  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3674  MATE efflux family protein  26 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 525 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  24.17 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  28.96 
 
 		 500 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 453 aa  97.1  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 486 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 445 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 455 aa  93.6  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 467 aa  93.6  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.42 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  26.96 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  21.97 
 
 		 462 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  23.31 
 
 		 459 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  21.81 
 
 		 446 aa  90.5  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.51 
 
 		 485 aa  90.5  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  22.29 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 498 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.42 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  21.68 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.76 
 
 		 462 aa  88.2  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 458 aa  87.4  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  28.37 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 445 aa  87  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  21.19 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  23.92 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  23.26 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  20.7 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  23.89 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  23.8 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.8 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  23.65 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.8 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.95 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  28.68 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  23.8 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  23.06 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 500 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  26.86 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.18 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.65 
 
 		 546 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  25.58 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  23.57 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  23.97 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  26.33 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  23.93 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  22.11 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  23.42 
 
 		 495 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  22.44 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.61 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  22.89 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  22.89 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  25.57 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  22.89 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  22.6 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  24.6 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  23.08 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  23.19 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  22.77 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.71 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  23.89 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  22.64 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5728  hypothetical protein  26.01 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  22.01 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>