More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0551 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
377 aa  768    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 
647 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  33.86 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  33.86 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  33.65 
 
 
849 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 
527 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  37.5 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  29.58 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  34.95 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.17 
 
 
554 aa  69.3  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 
539 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  29.75 
 
 
277 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  30.94 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  35.43 
 
 
596 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  35.2 
 
 
523 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.55 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.94 
 
 
597 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  31.9 
 
 
557 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  29.71 
 
 
503 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  35.11 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  29.36 
 
 
546 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.68 
 
 
620 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
539 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.96 
 
 
631 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  26.03 
 
 
583 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.51 
 
 
797 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  31.93 
 
 
542 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.77 
 
 
637 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 
544 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.96 
 
 
593 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  34.17 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 
733 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  33.58 
 
 
550 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  27.78 
 
 
560 aa  63.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.97 
 
 
515 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  29.75 
 
 
409 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  36.79 
 
 
444 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  33.33 
 
 
324 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  25 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  25 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  28.91 
 
 
563 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  25 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  25 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  35.78 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  27.19 
 
 
619 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  31.93 
 
 
266 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.35 
 
 
576 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  29.58 
 
 
634 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  31.62 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  30.39 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  29.03 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.01 
 
 
840 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  29.03 
 
 
334 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  23.86 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  25 
 
 
265 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  31.07 
 
 
301 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.87 
 
 
579 aa  60.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.31 
 
 
534 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  26.67 
 
 
264 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  33.62 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  32.43 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  29.2 
 
 
571 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 
570 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  31.43 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  25.77 
 
 
265 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  31.3 
 
 
498 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  34.07 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 
561 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  24.42 
 
 
265 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.38 
 
 
470 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.83 
 
 
581 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.43 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.48 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  28.17 
 
 
282 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  30.6 
 
 
290 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  32.71 
 
 
142 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  32.79 
 
 
661 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  27.56 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  30.33 
 
 
473 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  31.03 
 
 
515 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  29.57 
 
 
515 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  31.67 
 
 
495 aa  57.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  26.19 
 
 
271 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  33.57 
 
 
337 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 
1021 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  32.74 
 
 
517 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  30.37 
 
 
602 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.03 
 
 
515 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.09 
 
 
530 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  31.03 
 
 
515 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  31.3 
 
 
283 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  30.88 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  28.32 
 
 
301 aa  57  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  28.81 
 
 
534 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.36 
 
 
300 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  38.71 
 
 
203 aa  56.6  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 
518 aa  56.6  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>