100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4140 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  74.37 
 
 		 215 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  64.1 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  67.35 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  57.59 
 
 		 189 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  54.97 
 
 		 193 aa  177  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  43.27 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  48.28 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 428 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  43.1 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  39.74 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  41.25 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  36.23 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  39.34 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  22.33 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 194 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 216 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 249 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 216 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 214 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 203 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.1 
 
 		 258 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 214 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 211 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 187 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 415 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  26.29 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>