More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4559 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  40.39 
 
 		 1153 aa  720    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 1010 aa  2038    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  45.28 
 
 		 1098 aa  816    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  40.47 
 
 		 1041 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  37.8 
 
 		 1063 aa  605  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  36.75 
 
 		 1008 aa  580  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1129 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  36.7 
 
 		 1028 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1127 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  34.16 
 
 		 1059 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.4 
 
 		 1031 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1040 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.76 
 
 		 1065 aa  472  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 1093 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1059 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1142 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1135 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1153 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1147 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  32.39 
 
 		 1051 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1063 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  34.53 
 
 		 1065 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 1059 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 1105 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  31.96 
 
 		 1032 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  32.3 
 
 		 1058 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 1166 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1074 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1038 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.64 
 
 		 1165 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  30.89 
 
 		 1071 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1022 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1189 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1138 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1043 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 1073 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  30.66 
 
 		 1083 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1087 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1051 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1072 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1081 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 1050 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1073 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1011 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1234 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1078 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 962 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1036 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1102 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1071 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1033 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1071 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1081 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1033 aa  363  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1068 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 1137 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1047 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 1064 aa  360  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1169 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1115 aa  353  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  28.78 
 
 		 1025 aa  352  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1081 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1027 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 1039 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1186 aa  337  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1099 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1098 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1088 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1107 aa  327  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1163 aa  326  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1067 aa  324  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1088 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1138 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1044 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1176 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  27.98 
 
 		 1043 aa  267  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1116 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1084 aa  258  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 1063 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1057 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1128 aa  240  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1053 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1137 aa  228  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 1014 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 1035 aa  224  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 1049 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1102 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1038 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1029 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 1144 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1046 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1024 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 986 aa  211  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 976 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1011 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1040 aa  208  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1071 aa  208  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.64 
 
 		 1030 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>