More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_0702 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  52.8 
 
 
662 aa  710    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  100 
 
 
677 aa  1393    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0301  DNA ligase, NAD-dependent  84.3 
 
 
676 aa  1189    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.10932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  43.63 
 
 
715 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  45.03 
 
 
698 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  42.63 
 
 
699 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  42.76 
 
 
714 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.73 
 
 
717 aa  579  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  42.65 
 
 
714 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6162  DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase (NAD+))  42.53 
 
 
716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0825564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 
700 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.61 
 
 
718 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  42.98 
 
 
714 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  42.01 
 
 
708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  41.23 
 
 
716 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.23 
 
 
719 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1509  DNA ligase  41.24 
 
 
741 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.655718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2432  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 
710 aa  571  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.19 
 
 
718 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2066  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 
701 aa  561  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  40.75 
 
 
720 aa  555  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1754  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.93 
 
 
721 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1280  DNA ligase, NAD-dependent  42.3 
 
 
704 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.334632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.85 
 
 
719 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.85 
 
 
719 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1159  DNA ligase, NAD-dependent  41.67 
 
 
704 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.227634  normal  0.637978 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0500  DNA ligase, NAD-dependent  42.2 
 
 
670 aa  544  1e-153  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.147098  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2622  DNA ligase  42.71 
 
 
704 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.477478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.57 
 
 
717 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1997  DNA ligase, NAD-dependent  40.69 
 
 
703 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2504  DNA ligase, NAD-dependent  39.84 
 
 
752 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.234774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  40.03 
 
 
673 aa  528  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.19 
 
 
672 aa  525  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  39.88 
 
 
673 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.21 
 
 
694 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  40.15 
 
 
668 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.77 
 
 
697 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.48 
 
 
670 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.15 
 
 
668 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  40.55 
 
 
704 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4727  DNA ligase, NAD-dependent  37.92 
 
 
708 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254208  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.94 
 
 
673 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  39.82 
 
 
671 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  40.53 
 
 
674 aa  508  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1398  DNA ligase, NAD-dependent  38.53 
 
 
739 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.695979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  38.62 
 
 
672 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  39.12 
 
 
670 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.15 
 
 
673 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  38.91 
 
 
683 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  39.17 
 
 
673 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.57 
 
 
681 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.85 
 
 
670 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0757  DNA ligase, NAD-dependent  41.32 
 
 
682 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  39.12 
 
 
689 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  39.48 
 
 
685 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.7 
 
 
670 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  39.22 
 
 
726 aa  496  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0549  DNA ligase, NAD-dependent  38.07 
 
 
714 aa  497  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183807  normal  0.14967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  39.44 
 
 
690 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.29 
 
 
690 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3405  DNA ligase, NAD-dependent  40.36 
 
 
672 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.558724  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  39.5 
 
 
690 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.24 
 
 
670 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.46 
 
 
681 aa  497  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  38.73 
 
 
671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.5 
 
 
669 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  39.36 
 
 
681 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  39.09 
 
 
672 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.79 
 
 
669 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  38.42 
 
 
711 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 
671 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  38.36 
 
 
675 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.73 
 
 
671 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.55 
 
 
670 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.5 
 
 
669 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  39.82 
 
 
685 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1738  DNA ligase, NAD-dependent  36.11 
 
 
721 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00107521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3294  DNA ligase, NAD-dependent  40.21 
 
 
795 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36347  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.73 
 
 
671 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  38.72 
 
 
670 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.5 
 
 
669 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  39.82 
 
 
685 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.55 
 
 
670 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  39.97 
 
 
685 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  40.75 
 
 
693 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  38.97 
 
 
691 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.59 
 
 
671 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  39.24 
 
 
718 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.35 
 
 
669 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.35 
 
 
669 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  38.59 
 
 
671 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  38.43 
 
 
678 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.5 
 
 
669 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.59 
 
 
671 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.42 
 
 
671 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.67 
 
 
684 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.59 
 
 
671 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  39.85 
 
 
688 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.06 
 
 
669 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  39.09 
 
 
691 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>